Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms