Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms