Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms