Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc44a1Q6X893 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms