Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn5Q6VZZ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn5Q6VZZ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms