Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tfap2eQ6VUP9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms