Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rhox8Q6VSS7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms