Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc4Q6S5L9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc4Q6S5L9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms