Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms