Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms