Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc57Q6PHN1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms