Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med16Q6PGF3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms