Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim45Q6PFY8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms