Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms