Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Gapvd1Q6PAR5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms