Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms