Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Podnl1Q6P3Y9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms