Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4Q6P1D7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms