Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms