Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc8Q6NZB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc8Q6NZB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms