Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd2Q6NXI6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rprd2Q6NXI6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms