Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV72

Wdcp, WD repeat and coiled-coil-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WdcpQ6NV72 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
WdcpQ6NV72 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WdcpQ6NV72 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms