Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sohlh1Q6IUP1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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