Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CltbQ6IRU5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CltbQ6IRU5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms