Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt39Q6IFX4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt39Q6IFX4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms