Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms