Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp7Q6A4J8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp7Q6A4J8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms