Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmcc1Q69ZZ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Tmcc1Q69ZZ6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms