Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ric1Q69ZJ7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms