Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sh3rf1Q69ZI1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3rf1Q69ZI1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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