Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.2 ms