Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp4Q68FH0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pkp4Q68FH0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp4Q68FH0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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