Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC080695Q66JY9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms