Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ino80dQ66JY2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ino80dQ66JY2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms