Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VclQ64727 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VclQ64727 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
VclQ64727 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VclQ64727 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VclQ64727 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VclQ64727 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VclQ64727 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms