Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim24Q64127 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms