Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znf260Q62513 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf260Q62513 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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