Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt6hQ62383 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt6hQ62383 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms