Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms