Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms