Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd1Q62101 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.8 ms