Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PtafrQ62035 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtafrQ62035 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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