Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms