Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HlxQ61670 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HlxQ61670 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HlxQ61670 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HlxQ61670 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HlxQ61670 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms