Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EsrrbQ61539 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EsrrbQ61539 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms