Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itm2aQ61500 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms