Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms