Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcd1Q61466 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms