Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms