Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde3bQ61409 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde3bQ61409 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms